視頻 | 采用AI驅(qū)動的藥物設(shè)計(AIDD),加速化合物設(shè)計與ADMET篩選(英文)
視頻概述
課程第一部分介紹了理化性質(zhì)預(yù)測模塊,包括pKa,化合物在水中和在模擬胃腸液中的溶解度,表征滲透性的預(yù)測參數(shù),血漿蛋白結(jié)合率,表觀分布容積等,并展示了如何預(yù)測化合物對應(yīng)pKa在不同pH下的離子化形式和含量,如何快速預(yù)測BCS分類等。
第二部分介紹了代謝預(yù)測模塊,包括化合物是哪些CYP酶,UGT酶,醛氧化酶的底物,抑制劑,并演示了如何預(yù)測代謝位點,代謝產(chǎn)物。
第三部分介紹了轉(zhuǎn)運體模塊,包括預(yù)測化合物是哪些轉(zhuǎn)運體的底物或抑制劑,如P-gp,BCRP, OATP1B1/1B3, OCT1/2, OAT1/3, BSEP。
第四部分介紹了化合物設(shè)計模塊Medchem Studio,包括通過骨架等方法進行聚類,選擇懸崖分子對,R取代集團分析,SAR分析,化合物相似性篩選,產(chǎn)生衍生物庫,通過結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化規(guī)則產(chǎn)生批量新化合物。
最后介紹了AI驅(qū)動的藥物設(shè)計(AIDD)新模塊,該方法整合了機器學(xué)習(xí),生理藥代動力學(xué)PBPK等方法,第一步在系統(tǒng)中輸入要進行優(yōu)化的一個或多個種子化合物,并設(shè)置要優(yōu)化的ADMET性質(zhì)參數(shù),第二步系統(tǒng)將自動產(chǎn)生批量新化合物;第三步進行ADMET,生物利用度,合成難易度等篩選;第四步通過帕累托最優(yōu)(Pareto-optimal)找出整體最優(yōu)的一批化合物;如對結(jié)果不滿意,則通過該流程進行不斷的迭代,直到符合預(yù)期。
內(nèi)容概要
ADMET 性質(zhì)預(yù)測
化合物的快速設(shè)計
AI驅(qū)動的藥物設(shè)計AIDD算法簡介與案例演示
講解人
課程視頻
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